La haute autorité de santé recommande le dosage des transaminases d'une part pour le diagnostic des hépatites, d'autre part pour la surveillance des sujets à risque. Mais aussi pour la surveillance de l'efficacité du traitement d'une maladie déja diagnostiquée et aussi dans le cadre de la surveillance de traitement par des médicaments potentiellement aggressif pour le foie. Le dosage AZAT/ALAT est donc recommandé par l'HAS devant des signes évocateurs de souffrance hépatique c'est à dire des douleurs abdominales, des vomissements, une fatigue intense, et un ictère. L'ictère est du a un exces du pigment jaune de la bile dans le sang, la bilirubine. Elle colore alors en jaune la peau et les muqueuse. d'ou le nom de jaunisse. Elle est souvent due aux hépatite ou a l'obstruction des voies biliaires . Le dosage des AZAT/ALAT est aussi recommandé dans le cadre d'un bilan hépatique systématique pour déceler les sujets à risque avant le début d'un traitement comme certains contraceptif par exemple, en cas de consommation chronique d'alcool, s'il y a une surcharge pondérale, du diabète, et bien sur en cas de suspicion d'hépatite ou de stéatose. La stéatose hépatique est le stade qui précède les hépatites métabolique ou NASH. Appelée dans le langage courant « foie gras » non alcoolique. Elle peut évoluer en NASH, donc en hépatite, puis en fibrose et enfin si un traitement n'est pas entrepris, en cyrhose. Elle est donc d'origine métabolique et peut être consécutive a de l'obésité, du cholestérol élevé, du diabète, voir une hypertension artérielle. Elle se caractérise par une accumulation de graisses dans le foie, en dehors de toute consommation excessive d'alcool. Le dosage des AZAT/ALAT est aussi utilisé pour le suivi de l'efficacité du traitement des maladie hépatique connue comme les hépatite virale ou auto‐immune. Dans ce cas la souffrance des cellules hépatique est due aux anticorps dirigés contre le virus pour le détruire, détruisant au passage la cellule qui l'héberge, on parle alors d'hépatite virale. Ou a cause d'un dérèglement du systeme immunitaire qui ne reconnait plus ses cellules, on parle alors d'hépatites auto-immune. dans tous les cas les anticorps détruisent les cellules hépatiques. Autre maladie du foie le NASH, qui est une hépatite métabolique non alcoolique, c'est le stade suivant la stéatose. La diminution de la valeur des transaminases est un bon indicateur de l'efficacité de la thérapeutique entreprise Le dosage des transaminases est aussi utilisé pour la cirrhose. La cyrrhose est le stade ultime de la dégradation du foie, La cirrhose est généralement considérée comme peu ou pas réversible. La baisse des transaminases dans ce cas signe la fin du nombre de cellules hépatiques fonctionnelles. C'est pourquoi diagnostic et traitement doivent etre fait avant d'arriver à ce stade. Et enfin pour la surveillance de certains traitements hépatotoxiques comme les antirétroviraux, certains antifongiques, les chimiothérapies ou les immunomodulateurs, qui sont des médicaments qui régulent le système immunitaire, soit en le stimulant, soit en le supprimant pour traiter des maladies où la réponse immunitaire est excessive ou inadaptée, comme dans le cas des hépatites auto immunes par exemple. Une augmentation trop importante des transaminases necessitera l'arret de n'importe quel de ces médicaments.

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